Endonezya Ulusal Müzesinde tarih öncesine ait çok sayıda taş ve ahşap aletlerin yanı sıra insan kemikleri bulunuyor. Müze, çeşitli tarihlerde bölgede hakim olan Hinduizm, Budizm ve İslam kültürüne ait koleksiyonları da barındırıyor.`